آیتالله مصباح یزدی می فرمودند: مرحوم آقا مصطفی(ره) از پدرشان مرحوم امام(ره) نقل می کردند: «آقا معتقدند جناب آقای بهجت دارای مقامات معنوی بسیار ممتازی هستند. ایشان دارای موت اختیاری هستند، یعنی قدرت این را دارند که هر وقت بخواهند روح خویش را از بدن به اصطلاح خلع کنند و بعد مراجعت کنند.»

چند توصیه از مرحوم آیت الله العظمی بهجت فومنی قدس الله نفسه الزکیه و حشره الله مع من یتولاه :
اگر آنچه را كه مي دانيد عمل كنيد؛ كفايت مي كند.«در روایت هست: "من عمل بما علم کفی ما لم یعلم"
براى تثبيت در دين، در زمان غيبت همه بخوانيم كه:«يا اللّه يا رَحْمانُ يا رَحِيمُ، يا مُقَلِّبَ الْقُلُوبِ، ثَبِّتْ قَلْبِى عَلى دِينِكَ.»اى خدا، اى رحمت گستر، اى مهربان، اى زير و رو كننده ى دل ها، قلب مرا بر دينت استوار و ثابت بدار. وقت خواندن اين دعا همين روزها(چند روزه دنیا) مى باشد. اگر اين روزها اين دعا را نخوانيم پس كى مى خواهيم بخوانيم؟!
صبر بســـــیار بباید پدر پیر فلک را ... تا دگر مادر گیتی چو تو فرزند بزاید .
در پي رحلت حضرت آيت الله العظمي بهجت پيام تسليتي از طرف رهبر معظم انقلاب اسلامي منتشر شد. به گزارش پايگاه اطلاع رساني مقام معظم رهبري، متن پيام به اين شرح است:
بسم الله الرحمن الرحيم
انالله و انااليه راجعون
با دريغ و افسوس فراوان خبر يافتيم كه عالم رباني، فقيه عاليقدر و عارف روشن ضمير حضرت آيتالله آقاي حاج شيخ محمد تقي بهجت (قدس الله نفسه الزكيه) دار فاني را وداع گفته و به جوار رحمت حق پيوستند. براي اينجانب و همه ارادتمندان آن مرد بزرگ اين مصيبتي سنگين و ضايعهاي جبران ناپذير است. ثلم في الاسلام ثلمه لا يسدها شي.
آن بزرگوار كه از برجستگان مراجع تقليد معاصر به شمار ميرفتند معلم بزرگ اخلاق و عرفان و سرچشمه فيوضات معنوي بي پايان نيز بودند. دل نوراني و مصفاي آن پارساي پرهيزگار آينه روشن و صيقل يافته الهي و كلام معطر او راهنماي انديشه و عمل رهجويان وصالحان بود. اينجانب تسليت صميمانه خود را به پيشگاه حضرت بقيه الله (ارواحنا فداه) تقديم ميدارم و به حضرات علماي اعلام و مراجع عظام و شاگردان و ارادتمندان و مستفيضان از نفس گرم و به ويژه به خاندان مكرم و آقازاده ارجمند ايشان تسليت عرض ميكنم و براي خود و ديگر داغداران از خداوند متعال درخواست تسلي و براي روح مطهر آن بزرگوار طلب رحمت و مغفرت ميكنم.
والسلام عليه و رحمه الله
سيد علي خامنهاي
27 ارديبهشت 1388
23 جمادي الاولي 1430

